Nato nell'Ontario, cominciò i suoi studi nell'Università di Toronto, dove studiò medicina  e ricevette il suo M. D. nel 1916. Fu ufficiale medico durante la prima guerra Mondiale e dopo la guerra, nel 1921 insieme a John Macleod e Charles Best , cominciò i suoi studi sull'ormone insulina. Nel 1922 Banting e Macleod, presso il dipartimento di Fisiologia dell'Università di Toronto, riuscirono ad isolare l'ormone pancreatico, secreto dalle isole di Langerans, capace di regolare il tasso di zucchero del sangue, l'insulina.
Ricevettero il Premio Nobel in Fisiologia nel 1923 e furono i primi canadesi a ricevere questo onore. Banting, resosi conto dell'importanza del lavoro del suo assistente C. Best, decise di condividere con quest'ultimo il premio.
Nel 1941 Banting morì in un incidente aereo durante una missione militare medica in Canada.
 

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